Illustration du coronavirus SARS-CoV-2 Shutterstock/Naeblys
Autre année, autre variante. Avant même la fin de la vague omicron, le nombre croissant de cas causés par une variante de l’omicron connue sous le nom de BA.2 suscite des inquiétudes. Voici ce que nous savons sur BA.2.
Qu’est-ce que BA.2 ?
C’est fondamentalement une autre saveur d’omicron qui existe depuis le début. Le terme omicron est utilisé pour décrire toute une famille de variantes qui est apparu soudainement en novembre 2021. La plupart des cas d’omicron ont été causés par l’une de ces variantes connues des scientifiques sous le nom de BA.1. BA.2 a 32 des mêmes mutations que BA.1, mais il en a aussi 28 qui sont différentes. Le premier échantillon BA.2 a été collecté en Afrique du Sud le 17 novembre 2021.
Pourquoi en entend-on parler maintenant ?
Dans plusieurs pays, dont le Royaume-Uni, l’Allemagne, l’Inde et le Danemark, la proportion de cas causés par BA.2 augmente rapidement. En d’autres termes, BA.2 remplace BA.1, ce qui suggère qu’il est encore plus transmissible.
Dois-je m’inquiéter pour BA.2 ?
Si vous n’êtes pas vacciné et n’avez pas été infecté par omicron, alors oui. Si vous êtes infecté, même si vous ne tombez pas gravement malade, vous pourriez déclencher une chaîne d’infections entraînant la mort. Si vous êtes complètement vacciné et boosté, ou si vous avez déjà eu omicron, ces risques sont beaucoup plus faibles.
Puis-je être infecté par BA.2 si j’ai déjà eu omicron ?
Nous ne le savons pas encore, mais de nombreux chercheurs s’attendent à ce que si des personnes ont récemment été infectées par BA.1, il est peu probable qu’elles contractent BA.2, surtout si elles ont également été vaccinées. Cela ne veut pas dire que cela n’arrivera pas, mais les chiffres devraient être faibles. “Les anticorps suscités par BA.1 réagiront probablement encore raisonnablement bien contre BA.2, certainement beaucoup mieux que les anticorps delta”, déclare Jesse Bloom du Fred Hutchinson Cancer Research Center à Seattle, Washington.
Que faire si j’ai été vacciné mais que je n’ai pas reçu d’omicron ?
Les vaccins existants sont en fait encore plus efficaces pour protéger contre BA.2 que BA.1. Selon l’Agence britannique de sécurité sanitaire, trois doses de vaccin sont efficaces à 70% pour prévenir les infections symptomatiques par BA.2 deux semaines après le rappel, et 63 pour cent efficaces contre BA.1. Pour les personnes ayant reçu deux doses de vaccins, l’efficacité après 25 semaines est de 13 % contre BA.2 et de 9 % contre BA.1. Ce sont les chiffres combinés pour tous les vaccins utilisés au Royaume-Uni.
BA.2 provoquera-t-il une nouvelle vague de cas dans le monde ?
Espérons que non, même si cela pourrait prolonger les ondes omicron actuelles dans de nombreux pays. En Afrique du Sud, dont la vague omicron est déjà pratiquement terminée, il y a aucun signe de reprise bien qu’une forte proportion de cas soient désormais BA.2. “Je serais surpris si BA.2 provoquait des vagues majeures dans des endroits qui viennent d’avoir BA.1”, déclare Bloom. Cependant, les pays qui ont largement réussi à empêcher la propagation du coronavirus SARS-CoV-2 jusqu’à présent, comme le Japon, pourraient trouver encore plus difficile de supprimer BA.2 que BA.1. En d’autres termes, quelques pays pourraient avoir des vagues BA.2.
Tout cela signifie-t-il que BA.2 est moins dangereux que BA.1 ?
En pratique, probablement. Les facteurs qui déterminent la menace que représente un virus comprennent sa gravité inhérente, le nombre de personnes qu’il infecte et le degré de protection immunitaire de ces personnes. À notre connaissance, BA.2 n’est pas plus susceptible de provoquer une maladie grave que BA.1, mais il peut être 50 % plus transmissible. Des virus plus transmissibles peuvent causer plus d’hospitalisations et de décès en infectant plus de personnes, même s’ils ne sont pas plus graves. Cependant, dans de nombreux pays, une grande partie de la population bénéficie désormais d’une bonne immunité contre les rappels et les infections, ce qui devrait réduire considérablement à la fois le nombre et la gravité des infections à BA.2.
BA.2 est-il une « variante furtive » ?
Certaines personnes ont affirmé que BA.2 est une “variante furtive” qui n’est pas détectée par les tests, mais, en fait, elle est détectée à la fois par PCR et par les tests de flux latéral (rapide) comme toutes les autres variantes.
Les tests PCR du SARS-CoV-2 recherchent trois séquences courtes spécifiques au virus, et donnent un résultat positif si au moins deux sont détectées. L’une des séquences fait généralement partie du gène de la protéine de pointe, ou gène S. BA.1 omicron – comme certaines variantes antérieures – a des mutations qui signifient que la séquence du gène S n’est pas détectée, bien que le test PCR soit toujours positif. C’est ce qu’on appelle un abandon du gène S.
Normalement, le seul moyen de détecter les variantes est le séquençage, mais en recherchant les abandons du gène S, de nombreux laboratoires ont pu voir comment BA.1 omicron prenait le relais de delta uniquement à partir de tests PCR. BA.2 ne provoque pas d’abandon du gène S, il n’a donc pas pu être distingué de delta à l’aide de la PCR – d’où le terme impropre “furtif”. Cependant, maintenant que delta a largement disparu dans de nombreux endroits, une proportion décroissante d’abandons du gène S révèle la propagation de BA.2, il est donc tout sauf furtif.
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